Digitale Auswertung und 3D-Rekonstruktion

Die digitale Auswertung rundet den Servicebreich ‘Histologie’ ab. Von Ihren Schnitten oder Schnittserien stellen wir Ihnen digitale Übersichtsaufnahmen oder nach Ihrer Anweisung auch digitale Aufnahmen von Detailvergrößerungen mit hochwertigen Mikroskopen her. Sie erhalten auf Wunsch auch druckfertige Fototafeln mit Maßstäben, die Sie nur noch in Ihre Publikation einfügen müssen.

Von Schnittserien ab 100 Einzelschnitte erstellen wir Ihnen 3D-Modelle mit unserer speziell für weich eingebettete Materialien entwickelten 3D-Rekonstruktions-Software HistoStack3D. Sie erhalten von uns dann eine CD oder DVD mit allen digitalisierten Bildern, einem angepaßten Bildstapel als HistoStack-Datei und als MPEG-Film, sowie einen MPEG-Film des 3D-Modells, das wir gemäß Ihrer Angaben hergestellt haben. Wenn Sie Ihren 3D-Datensatz in anderen Applikationen weiterverarbeiten möchten, bieten wir Ihnen den Export in gängige 3D-Formate an (3DStudioMax, Cinema4D, VRML, DXF, u.A.).

Wenn Sie bereits fertige Schnittserien haben, können Sie uns auch diese zusenden, und wir erstellen Ihnen die gewünschten 3D-Modelle. Bei größerem Auftragsvolumen lohnt sich für Sie ggf. auch der Kauf des kompletten Software-Paketes und eine Schulung in der professionellen Anwendung.

Verarbeitungsschritte:

HistoStack3D unterstützt den Rekonstruktionsvorgang mit den folgenden, auch einzeln erhältlichen Modulen:

Schritt 1: Bildanpassung und Stapelgenerierung

Bilder einer histologischen Schnittserie benötigen im Gegensatz zu CT- und MRT-Datensätzen eine räumliche Referenzierung und Anpassung. Aber gerade bei der weit verbreiteten Paraffineinbettung stellt die Bildreferenzierung und -alignierung ein großes Problem dar. Nur selten gelingt es, diese mit den für die Bildanpassung notwendigen Referenzmarken zu versehen. Zudem weisen sie im Vergleich zu Kunstoffpräparaten stärkere Deformationen auf. Hier setzt HistoStack3D an. Mit fortgeschrittenen Korrekturverfahren wird es möglich, auch ohne Referenzmarken nahezu vollständig entzerrte Bilderstapel und damit aussagekräftige Modelle aus Paraffinpräparaten zu erstellen, ohne auf eine aufwändige Kunststoffein- bettung zurückgreifen zu müssen.

Schritt 2: Segmentierung und Modellgenerierung

Unterschiedliche Gewebetypen werden anhand ihrer spezifischen Färbung vorselektiert und damit eine Segmentierung des dreidimensionalen Datensatzes vorgenommen.

Diese Vorselektion segmentierter Bereiche erlaubt es schließlich modellrelevante Informationen von Artefakten zu differenzieren. Im endgültigen 3D-Modell werden somit nur die gewünschten Komponenten angezeigt. Neben der Erzeugung von Polygonmodellen kann dies dazu genutzt werden, bereits im Bilderstapel eine Modell-Konfiguration festzulegen, die sich mit unserem Visualisierungsmodul sowie Analysetools von Drittanbietern analysieren lassen.

Schritt 3: Visualisierung und Auswertung

Vielfältige Interaktionsmöglichkeiten mit Bilderstapeln und Polygonmodellen verbunden mit einer einfachen und intuitiven Steuerung kennzeichnen das Visualisierungsmodul von HistoStack3D. Zu den herausragenden Darstellungsmöglichkeiten gehören Schnittflächen und Schnittwürfel in beliebiger Anzahl, Größe und Orientierung, die beim Einsatz von gängigen 3D-Grafikkarten in Echtzeit manipuliert werden können und dadurch die Orientierung und Navigation im Modell erheblich erleichtern. Eine weitere Möglichkeit zur Erhöhung der Darstellungsqualität liegt in der individuellen Vergabe von Farbattributen für jedes Einzelobjekt. Zur Wahl stehen Falschfarben, Originalfarben sowie benutzerdefinierte Farben. Frei definierbare Transparenzeigenschaften ergänzen die Darstellungsmöglichkeiten.

Der Objektbrowser erlaubt den komfortablen Zugriff sowie eine beliebige hierarchische Anordnung und Gruppierung der Einzelobjekte. Zusätzliche Spezialobjekte dienen der Vermessung von Flächen, Winkeln und Distanzen und werden ebenfalls im Objektbrowser verwaltet. Vom Benutzer vorgegebene Wegepunkte ermöglichen animierte Kamerafahrten durch das Modell.

Weitere Informationen
Telefon: 069 / 2602 5414
per e-mail: histologie[at]morphisto.de